MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aeropyrum camini SY1 = JCM 12091 DNA

Total Repeats: 32264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_022521	CTAACA	2	12	306694	306705	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	549454979
6003	NC_022521	TCC	2	6	306710	306715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454979
6004	NC_022521	GGC	2	6	306732	306737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454979
6005	NC_022521	GCC	2	6	306784	306789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454979
6006	NC_022521	GAG	2	6	306866	306871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454980
6007	NC_022521	AGC	2	6	306916	306921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454980
6008	NC_022521	TGC	2	6	306937	306942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454980
6009	NC_022521	TGG	2	6	307003	307008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454980
6010	NC_022521	GA	3	6	307022	307027	50 %	0 %	50 %	0 %	549454980
6011	NC_022521	GCC	2	6	307065	307070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454980
6012	NC_022521	CTC	2	6	307104	307109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454980
6013	NC_022521	CAG	2	6	307131	307136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454980
6014	NC_022521	AGG	2	6	307378	307383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454981
6015	NC_022521	GTA	2	6	307438	307443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454981
6016	NC_022521	GCCA	2	8	307449	307456	25 %	0 %	25 %	50 %	549454981
6017	NC_022521	GCG	2	6	307457	307462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454981
6018	NC_022521	CCAG	2	8	307482	307489	25 %	0 %	25 %	50 %	549454981
6019	NC_022521	GGC	2	6	307507	307512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454981
6020	NC_022521	AAG	2	6	307534	307539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454981
6021	NC_022521	AGGG	2	8	307543	307550	25 %	0 %	75 %	0 %	549454981
6022	NC_022521	ATCT	2	8	307555	307562	25 %	50 %	0 %	25 %	549454981
6023	NC_022521	G	7	7	307609	307615	0 %	0 %	100 %	0 %	549454981
6024	NC_022521	AGG	2	6	307687	307692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454981
6025	NC_022521	G	7	7	307691	307697	0 %	0 %	100 %	0 %	549454981
6026	NC_022521	CCT	2	6	307740	307745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454981
6027	NC_022521	G	7	7	307756	307762	0 %	0 %	100 %	0 %	549454981
6028	NC_022521	AGG	2	6	307768	307773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454981
6029	NC_022521	CTT	2	6	307839	307844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454982
6030	NC_022521	CCT	2	6	307857	307862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454982
6031	NC_022521	AACCTC	2	12	307917	307928	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	549454982
6032	NC_022521	C	6	6	307973	307978	0 %	0 %	0 %	100 %	549454982
6033	NC_022521	TGA	2	6	308054	308059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454982
6034	NC_022521	CCTC	2	8	308096	308103	0 %	25 %	0 %	75 %	549454982
6035	NC_022521	TAT	2	6	308184	308189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454982
6036	NC_022521	ATC	2	6	308197	308202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454982
6037	NC_022521	GGT	2	6	308247	308252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454982
6038	NC_022521	TCG	2	6	308317	308322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454982
6039	NC_022521	CTC	2	6	308323	308328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454982
6040	NC_022521	TCG	2	6	308332	308337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454982
6041	NC_022521	AGG	2	6	308365	308370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454982
6042	NC_022521	ACC	2	6	308464	308469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454982
6043	NC_022521	CGT	2	6	308511	308516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454982
6044	NC_022521	TAT	2	6	308573	308578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454982
6045	NC_022521	GGC	2	6	308662	308667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454982
6046	NC_022521	TAG	2	6	308705	308710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454982
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6048	NC_022521	G	7	7	308861	308867	0 %	0 %	100 %	0 %	549454982
6049	NC_022521	TCC	2	6	308897	308902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454982
6050	NC_022521	CTC	2	6	308913	308918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454982
6051	NC_022521	TCC	2	6	308927	308932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454982
6052	NC_022521	TCC	2	6	309094	309099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454982
6053	NC_022521	ACA	3	9	309100	309108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549454982
6054	NC_022521	CTT	2	6	309183	309188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454982
6055	NC_022521	ATC	2	6	309259	309264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454982
6056	NC_022521	ACA	2	6	309283	309288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549454982
6057	NC_022521	GCC	2	6	309571	309576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454983
6058	NC_022521	GGA	2	6	309597	309602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454983
6059	NC_022521	CCA	2	6	309614	309619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454983
6060	NC_022521	G	7	7	309627	309633	0 %	0 %	100 %	0 %	549454983
6061	NC_022521	AGC	2	6	309666	309671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454983
6062	NC_022521	AC	3	6	309674	309679	50 %	0 %	0 %	50 %	549454983
6063	NC_022521	CCTA	2	8	309683	309690	25 %	25 %	0 %	50 %	549454983
6064	NC_022521	GAG	2	6	309717	309722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454983
6065	NC_022521	CGC	2	6	309753	309758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454983
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6067	NC_022521	G	7	7	309867	309873	0 %	0 %	100 %	0 %	549454983
6068	NC_022521	CCT	3	9	309882	309890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454983
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6070	NC_022521	GAGGC	2	10	309919	309928	20 %	0 %	60 %	20 %	549454983
6071	NC_022521	C	6	6	309928	309933	0 %	0 %	0 %	100 %	549454983
6072	NC_022521	CGT	2	6	309945	309950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454983
6073	NC_022521	GGATG	2	10	309972	309981	20 %	20 %	60 %	0 %	549454983
6074	NC_022521	GAG	2	6	310051	310056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454983
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6085	NC_022521	G	6	6	310448	310453	0 %	0 %	100 %	0 %	549454984
6086	NC_022521	CCTG	2	8	310549	310556	0 %	25 %	25 %	50 %	549454984
6087	NC_022521	TC	3	6	310579	310584	0 %	50 %	0 %	50 %	549454984
6088	NC_022521	GCT	2	6	310652	310657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454984
6089	NC_022521	CCCT	2	8	310731	310738	0 %	25 %	0 %	75 %	549454984
6090	NC_022521	CGAGG	2	10	310739	310748	20 %	0 %	60 %	20 %	549454984
6091	NC_022521	CAT	2	6	310763	310768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454984
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6093	NC_022521	ACC	2	6	310818	310823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454984
6094	NC_022521	GCG	2	6	310827	310832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454984
6095	NC_022521	ATC	2	6	310980	310985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454984
6096	NC_022521	CGC	2	6	310988	310993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454984
6097	NC_022521	GGCTC	2	10	311029	311038	0 %	20 %	40 %	40 %	549454984
6098	NC_022521	C	6	6	311057	311062	0 %	0 %	0 %	100 %	549454984
6099	NC_022521	C	7	7	311100	311106	0 %	0 %	0 %	100 %	549454984
6100	NC_022521	TACG	2	8	311114	311121	25 %	25 %	25 %	25 %	549454984
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6106	NC_022521	ACCCT	2	10	311418	311427	20 %	20 %	0 %	60 %	549454984
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6108	NC_022521	C	6	6	311520	311525	0 %	0 %	0 %	100 %	549454984
6109	NC_022521	CAC	2	6	311555	311560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454984
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6117	NC_022521	G	7	7	311901	311907	0 %	0 %	100 %	0 %	549454985
6118	NC_022521	CCTC	2	8	311961	311968	0 %	25 %	0 %	75 %	549454985
6119	NC_022521	CTC	2	6	311974	311979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454985
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6122	NC_022521	GAG	2	6	312067	312072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454985
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6124	NC_022521	ATA	2	6	312113	312118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549454985
6125	NC_022521	AGG	2	6	312283	312288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454986
6126	NC_022521	ATA	2	6	312312	312317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549454986
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6128	NC_022521	GGA	2	6	312452	312457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454986
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6141	NC_022521	CTT	2	6	314517	314522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454988
6142	NC_022521	CTGT	2	8	314559	314566	0 %	50 %	25 %	25 %	549454988
6143	NC_022521	TCG	2	6	314646	314651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454988
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6145	NC_022521	CCT	2	6	314743	314748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454988
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6154	NC_022521	CAG	2	6	315143	315148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454989
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6163	NC_022521	CCT	2	6	315496	315501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454990
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6245	NC_022521	TGGCG	2	10	320530	320539	0 %	20 %	60 %	20 %	549454996
6246	NC_022521	GTT	2	6	320639	320644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549454996
6247	NC_022521	GGA	2	6	320650	320655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454996
6248	NC_022521	AT	3	6	320672	320677	50 %	50 %	0 %	0 %	549454996
6249	NC_022521	CAC	2	6	320708	320713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454996
6250	NC_022521	GGC	2	6	320734	320739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454996
6251	NC_022521	TGA	2	6	320800	320805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454996
6252	NC_022521	GCAGA	2	10	320947	320956	40 %	0 %	40 %	20 %	549454996
6253	NC_022521	ATG	2	6	320972	320977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454996
6254	NC_022521	GCG	2	6	321005	321010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454996
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6258	NC_022521	AGGAGC	2	12	321269	321280	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	549454996
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6260	NC_022521	TGA	2	6	321478	321483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454996
6261	NC_022521	CCT	2	6	321683	321688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454997
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6264	NC_022521	GCT	2	6	321958	321963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454997
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6266	NC_022521	AGGG	2	8	322121	322128	25 %	0 %	75 %	0 %	549454997
6267	NC_022521	GT	3	6	322225	322230	0 %	50 %	50 %	0 %	549454997
6268	NC_022521	TCC	2	6	322270	322275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454997
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6270	NC_022521	CGGGAG	2	12	322315	322326	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	549454997
6271	NC_022521	CCT	2	6	322340	322345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454997
6272	NC_022521	GCC	2	6	322385	322390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454997
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6274	NC_022521	CTG	2	6	322465	322470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454998
6275	NC_022521	GTA	2	6	322537	322542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454998
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6277	NC_022521	CATG	2	8	322632	322639	25 %	25 %	25 %	25 %	549454998
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6286	NC_022521	GAG	2	6	322988	322993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454998
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6350	NC_022521	TAC	2	6	326411	326416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549455001
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6353	NC_022521	AG	4	8	326641	326648	50 %	0 %	50 %	0 %	549455001
6354	NC_022521	CAG	2	6	326763	326768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549455001
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6361	NC_022521	TGG	2	6	327005	327010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549455001
6362	NC_022521	GTG	2	6	327043	327048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549455001
6363	NC_022521	AG	3	6	327055	327060	50 %	0 %	50 %	0 %	549455001
6364	NC_022521	ACG	2	6	327122	327127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549455001
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6488	NC_022521	CCT	2	6	335310	335315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455016
6489	NC_022521	TCA	2	6	335342	335347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549455016
6490	NC_022521	C	6	6	335363	335368	0 %	0 %	0 %	100 %	549455016
6491	NC_022521	C	7	7	335374	335380	0 %	0 %	0 %	100 %	549455016
6492	NC_022521	GAG	2	6	335433	335438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549455016
6493	NC_022521	AGC	2	6	335468	335473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549455016
6494	NC_022521	CGC	2	6	335522	335527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549455016
6495	NC_022521	TGT	2	6	335549	335554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549455016
6496	NC_022521	CTC	2	6	335598	335603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455016
6497	NC_022521	CTC	2	6	335641	335646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455016
6498	NC_022521	TCC	2	6	335714	335719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455016
6499	NC_022521	GAG	2	6	335745	335750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549455016
6500	NC_022521	TTTACC	2	12	335758	335769	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	549455016

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